22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  100 
 
 		 2281 aa  4541    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0375  hypothetical protein  30.44 
 
 		 2320 aa  197  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  27.68 
 
 		 863 aa  141  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  33.07 
 
 		 963 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  32.68 
 
 		 1402 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  38.97 
 
 		 1562 aa  119  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  37.62 
 
 		 883 aa  107  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.89 
 
 		 1019 aa  97.1  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  25 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.23 
 
 		 2724 aa  73.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  43.97 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  41.9 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.31 
 
 		 1064 aa  67  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00100  putative cell wall binding protein  38.89 
 
 		 172 aa  59.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24300  hypothetical protein  37.62 
 
 		 362 aa  56.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  27.11 
 
 		 2553 aa  53.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.24 
 
 		 2122 aa  51.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  29.17 
 
 		 2268 aa  51.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  26.87 
 
 		 3333 aa  47.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  32.33 
 
 		 942 aa  46.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1194  magnesium-translocating P-type ATPase  30.11 
 
 		 971 aa  46.2  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.43 
 
 		 3486 aa  46.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>