279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2212 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.36 
 
 
272 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.54 
 
 
218 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.27 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  35.98 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  37.76 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.53 
 
 
381 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.68 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  37.37 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  34.21 
 
 
284 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.86 
 
 
285 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.58 
 
 
272 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  33.33 
 
 
285 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.62 
 
 
272 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.71 
 
 
269 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  27.43 
 
 
316 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  32.34 
 
 
270 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  31.4 
 
 
284 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.77 
 
 
271 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  34.41 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  31.58 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  31.22 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  30.13 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  29.41 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.66 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  36.9 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.22 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  29.3 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  29.86 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  31.58 
 
 
558 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  34.04 
 
 
281 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.08 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  29.59 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  35.22 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.92 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  31.02 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  26.38 
 
 
285 aa  92.4  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
268 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.77 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.29 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.52 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  30.39 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.24 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.41 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.39 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  30.39 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  33.96 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  31.34 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  29.34 
 
 
269 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  28.96 
 
 
272 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  28.79 
 
 
288 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  23.5 
 
 
319 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.65 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  30.83 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  28.95 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  30 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  31.34 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  23.5 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  35.19 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  27.45 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  33.53 
 
 
277 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.61 
 
 
285 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
435 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  32.93 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.92 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.93 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  29.1 
 
 
630 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  30.26 
 
 
298 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.07 
 
 
300 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.47 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  28.5 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.77 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  29.41 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  32.97 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  29.41 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  31.19 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.41 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.41 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  35.29 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  30.72 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  30.5 
 
 
562 aa  82  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.34 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  27.92 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.86 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.54 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.45 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  29.41 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  25.37 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  27.55 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  28.06 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>