194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2136 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.59 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  53.47 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  53.96 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  49.76 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.69 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  52.48 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  48.78 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.28 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  47.91 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  50.78 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  51.26 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  47.83 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  47.83 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  45.89 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.28 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  50 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.5 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.74 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  45.02 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.24 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.08 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  44.5 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  43.5 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.11 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  49.01 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  43.07 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  43.13 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.57 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.27 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.06 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.37 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.95 
 
 		 213 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.39 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.24 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  43.59 
 
 		 534 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  36.53 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 		 541 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.81 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.33 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  39.18 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  34.58 
 
 		 210 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.73 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  37.91 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.45 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  39.18 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  40.49 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  41.62 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  36.41 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  43.15 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  42.42 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.5 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  43.55 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  39.62 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  42.31 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  42 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  42.13 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  41 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  35.24 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0939  Precorrin-8X methylmutase  46.52 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1718  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.91 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  41.41 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.43 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  39.29 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  40.39 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  43.92 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  40.5 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  44.39 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38 
 
 		 520 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  40.61 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.88 
 
 		 451 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  43.15 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  43.28 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  38.92 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  39.47 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>