23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0885 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  847    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  39.25 
 
 		 1037 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  37.55 
 
 		 689 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  38.69 
 
 		 918 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  29.73 
 
 		 533 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2060  hypothetical protein  48.8 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2050  hypothetical protein  33.72 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.27061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  37.61 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  29.24 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1168 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  27.89 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  34.42 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  32.26 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1481  hypothetical protein  42.57 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  28.68 
 
 		 650 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2342  hypothetical protein  36.56 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  24.67 
 
 		 781 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  26.9 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  32.98 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  28.44 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  32.36 
 
 		 1068 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01506  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>