28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3656 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3656  putative ATPase component of ABC transporter with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3657  putative ATPase component of ABC transporter with duplicated ATPase domain  95.89 
 
 		 73 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3828  putative ATPase of ABC transporter with duplicated ATPase domain-containing protein  93.15 
 
 		 73 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3765  putative ATPase component of ABC transporter with duplicated ATPase domain  90.41 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.465941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3730  putative ATPase of ABC transporter with duplicated ATPase domain  90.41 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3771  LysR family transcriptional regulator  65 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368263  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1239  transcriptional regulator, LysR family  60 
 
 		 310 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2604  transcriptional regulator, LysR family  59.65 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1770  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6326  transcriptional regulator, LysR family  43.33 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5377  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0955  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0451  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.1 
 
 		 308 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5078  malonate utilization transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1014  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131098  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3934  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4924  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4938  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.182259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3862  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.484372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2897  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 329 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10390  malonate utilisation transciptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1230  transcriptional regulator, LysR family  41.07 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0301  malonate utilization transcriptional regulator  39.29 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02650  putative malonate utilization transcriptional regulator  39.29 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883739  normal  0.518056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5293  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143312  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2874  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0140369  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2743  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0626  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>