71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4878 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4878    100 
 
 		 534 bp  1059    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  94.27 
 
 		 300 bp  285  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  93.23 
 
 		 300 bp  270  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  92.71 
 
 		 300 bp  262  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  93.41 
 
 		 300 bp  258  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  87.45 
 
 		 867 bp  228  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  87.45 
 
 		 867 bp  228  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    86.61 
 
 		 540 bp  212  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    85.65 
 
 		 1163 bp  192  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  86.03 
 
 		 528 bp  192  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    85.23 
 
 		 1163 bp  184  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4578    93.2 
 
 		 207 bp  149  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    93.2 
 
 		 207 bp  149  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  84.07 
 
 		 309 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  93.02 
 
 		 897 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  84.07 
 
 		 300 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  84.07 
 
 		 300 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  84.07 
 
 		 300 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  84.07 
 
 		 300 bp  123  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  83.52 
 
 		 309 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  83.52 
 
 		 309 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  83.52 
 
 		 300 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  83.52 
 
 		 309 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  83.52 
 
 		 309 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  88.39 
 
 		 624 bp  111  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    88.39 
 
 		 561 bp  111  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    93.24 
 
 		 641 bp  107  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    89.61 
 
 		 468 bp  89.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01519    83.33 
 
 		 267 bp  83.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    91.53 
 
 		 868 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    91.53 
 
 		 834 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  91.53 
 
 		 867 bp  77.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    88.41 
 
 		 854 bp  73.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  80.62 
 
 		 816 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    80.62 
 
 		 868 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  80.62 
 
 		 807 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    80.62 
 
 		 868 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    89.83 
 
 		 868 bp  69.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    86.76 
 
 		 825 bp  63.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  86.84 
 
 		 300 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 297 bp  61.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  85.37 
 
 		 300 bp  60  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 957 bp  48.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0073    93.55 
 
 		 299 bp  46.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>