68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4830 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  96.81 
 
 
94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  95.74 
 
 
94 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  80.85 
 
 
94 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  95.74 
 
 
94 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.02 
 
 
95 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  67.02 
 
 
95 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  67.02 
 
 
95 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  63.83 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  68.09 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.02 
 
 
94 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.02 
 
 
94 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  67.02 
 
 
94 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  67.02 
 
 
94 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  63.44 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  69.15 
 
 
96 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  60.64 
 
 
96 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  60.22 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.38 
 
 
95 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.38 
 
 
94 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  59.14 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.32 
 
 
95 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  61.29 
 
 
93 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  56.38 
 
 
103 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  61.29 
 
 
93 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  56.32 
 
 
94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  55.32 
 
 
96 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  56.32 
 
 
94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  55.17 
 
 
94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  55.91 
 
 
95 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  55.91 
 
 
96 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  54.26 
 
 
95 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  54.26 
 
 
94 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  55.32 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  58.51 
 
 
96 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  56.99 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  61.84 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  62.32 
 
 
81 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.69 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  52.44 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  65.22 
 
 
72 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  65.22 
 
 
72 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  58.51 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  53.42 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  70.83 
 
 
49 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  68.75 
 
 
49 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  55.17 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  55.17 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  56.6 
 
 
61 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  66 
 
 
50 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  63.89 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  70.59 
 
 
35 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  70.59 
 
 
35 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  64.71 
 
 
48 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1797  hypothetical protein  30.69 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.333755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  28.92 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  36.05 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  32.35 
 
 
98 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>