60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1012 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  100 
 
 		 93 aa  190  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 93 aa  190  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  63.44 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.37 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  60.22 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  60.22 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  60.22 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  59.14 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  60.22 
 
 		 94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  59.14 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  58.06 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  53.76 
 
 		 94 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  56.32 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  52.69 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  55.91 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  64.47 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  60.22 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  60.27 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  59.14 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  53.76 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.78 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  53.76 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  59.14 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  53.76 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  52.69 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  59.14 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  65.28 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  65.28 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  58.06 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  56.99 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  54.44 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  51.61 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.61 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  58.06 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  51.61 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.61 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  52.69 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  48.39 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  52.13 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  56.99 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 		 95 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.74 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.74 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  51.22 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  55.71 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  55.91 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  52.69 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  54.44 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  62 
 
 		 50 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  60 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  61.9 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  61.76 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  58.33 
 
 		 37 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1797  hypothetical protein  28.71 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  36.05 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>