42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1997 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  100 
 
 
37 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  97.22 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  97.22 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  97.22 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  97.22 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  77.78 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  77.78 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  77.78 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  72.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  75 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  69.44 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  66.67 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  63.89 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  69.44 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  63.89 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  63.89 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  63.89 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  69.44 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.11 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  61.11 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  58.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  63.89 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  58.33 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  66.67 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  66.67 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  61.11 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  61.11 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  61.11 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  61.11 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  61.11 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  58.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  58.33 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  55.56 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  55.56 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.5 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  55.56 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  61.11 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  55.56 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>