54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1208 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  76.81 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.32 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  62.32 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  62.32 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  60.29 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  62.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  62.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.7 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  62.5 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  60.29 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  61.19 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  59.7 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  61.19 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  61.19 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.71 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  55.71 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  59.7 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  55.22 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.73 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  51.95 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  50.72 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  60.56 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  51.43 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  50.7 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  55.22 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  49.25 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  53.73 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  53.73 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  53.73 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  62.32 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  62.32 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  54.41 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  60.87 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.28 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.76 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  51.47 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.28 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.25 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  62 
 
 		 50 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  60.42 
 
 		 49 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  58.33 
 
 		 49 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  56.52 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  60.42 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  54.41 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.57 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  42.65 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  69.44 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.33 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  50.91 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  55.71 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>