23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03534 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  86.11 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  86.11 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  61.76 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  58.82 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.82 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  58.82 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  58.82 
 
 		 49 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.82 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.88 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  57.14 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  60 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  63.33 
 
 		 49 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  58.06 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  60.61 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  57.58 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>