39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0840 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  100 
 
 		 61 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  60.38 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  58.49 
 
 		 94 aa  67  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  56.6 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  56.6 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  56.6 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  58.49 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  56.6 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  58.49 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.49 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.49 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  54.72 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  58.49 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  71.43 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  52.83 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  52.83 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.83 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  68.57 
 
 		 35 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  68.57 
 
 		 35 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  65.71 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  45.28 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  64.71 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  60 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  64.71 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  60 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  61.11 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  57.14 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  50 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  60 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  61.76 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.76 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  61.76 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  61.11 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  62.5 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  52.27 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  45.28 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  55.88 
 
 		 85 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>