87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3603 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  42.86 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  53.45 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  49.3 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  53.45 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  39.02 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  38.1 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.29 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.29 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  39.29 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  39.29 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  36.9 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  38.82 
 
 		 93 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.18 
 
 		 95 aa  62  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  36.9 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  36.9 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  38.1 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 88 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  38.1 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  38.1 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  36.9 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.96 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  38.16 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  39.29 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  37.8 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.96 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  43.24 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  38.1 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  34.52 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  36.9 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4547  prevent-host-death family protein  46.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  44.12 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  40.85 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  31.71 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3375  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  34.12 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  45.76 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  41.27 
 
 		 74 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  38.89 
 
 		 93 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.07 
 
 		 106 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 		 83 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 		 94 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  39.71 
 
 		 85 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  34.52 
 
 		 95 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  40.35 
 
 		 97 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  40.32 
 
 		 94 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  40.32 
 
 		 94 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 81 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  34.69 
 
 		 96 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  41.33 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  43.55 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.16 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  41.38 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  43.55 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  38.71 
 
 		 94 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  34.72 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  38.89 
 
 		 82 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  41.38 
 
 		 82 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 82 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  34.29 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  34.29 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  34.29 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0003  antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family  32.35 
 
 		 83 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  31.08 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  40.68 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1587  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0286  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  33.82 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.906881  normal  0.323322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0277  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.799247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3348  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3375  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  39.66 
 
 		 83 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00227  predicted antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  37.68 
 
 		 77 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  40.35 
 
 		 95 aa  41.2  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  38.6 
 
 		 95 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>