32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3375 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3375  prevent-host-death family protein  100 
 
 
97 aa  197  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00230  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0277  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  98.97 
 
 
97 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.799247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00227  predicted antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  98.97 
 
 
97 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3348  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  98.97 
 
 
97 aa  196  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0286  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  97.94 
 
 
97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.906881  normal  0.323322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  44.93 
 
 
81 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  39.71 
 
 
81 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  36.76 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  36.14 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  44.83 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  44.83 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  30.43 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  36.92 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  30.43 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  34.85 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  34.85 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  34.85 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  35 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  37.31 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  35 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  35.71 
 
 
81 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>