34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0286 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0286  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.906881  normal  0.323322 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3375  prevent-host-death family protein  97.94 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00227  predicted antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  96.91 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00230  hypothetical protein  96.91 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0277  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  96.91 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.799247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3348  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  96.91 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  46.38 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  39.71 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  37.35 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  38.24 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  41.54 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  41.79 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  34.85 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  35.71 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  35.71 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  31.88 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  31.88 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  33.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  33.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  33.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 		 176 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  37.88 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3784  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>