45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1265 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  97.59 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  49.4 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  50.6 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  49.4 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  44.58 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3375  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  44.58 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4547  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  53.45 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1587  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0318  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.07108  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  43.28 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  36.14 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  41.33 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0889  stability protein StbD, putative  41.25 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1011  protein of unknown function DUF172  41.25 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164621  hitchhiker  0.000000000602107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  33.73 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3687  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726516  normal  0.144685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3784  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0116  putative stability protein StbD  36.25 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000696013  normal  0.795005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  32.53 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0003  antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family  38.81 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  36.25 
 
 		 82 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  36.25 
 
 		 82 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  36.25 
 
 		 82 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  36.14 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  38.75 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0286  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  31.88 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.906881  normal  0.323322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0277  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.799247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00227  predicted antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00230  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3348  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3375  prevent-host-death family protein  30.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>