More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3322 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3322  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0755  GDXG family lipase  62.36 
 
 		 337 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3780  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.64 
 
 		 305 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.64 
 
 		 305 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  57.67 
 
 		 304 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3486  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.37 
 
 		 304 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3657  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.02 
 
 		 305 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0648  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.02 
 
 		 305 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3188  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.73 
 
 		 305 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3316  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.06 
 
 		 304 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0637  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.06 
 
 		 304 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4356  acetyl esterase  54.12 
 
 		 309 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4421  acetyl esterase  54.12 
 
 		 309 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0112532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4243  acetyl esterase  52.63 
 
 		 309 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4265  acetyl esterase  52.35 
 
 		 309 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4310  acetyl esterase  53.53 
 
 		 309 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0866063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4412  alpha/beta fold family hydrolase  51.5 
 
 		 302 aa  174  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1460  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.8 
 
 		 308 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4089  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.82 
 
 		 304 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02182  hypothetical protein  57.58 
 
 		 104 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.69 
 
 		 311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.01 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.27 
 
 		 316 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.47 
 
 		 311 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02184  hypothetical protein  62.16 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  34.87 
 
 		 309 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.96 
 
 		 323 aa  97.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  37.34 
 
 		 312 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.29 
 
 		 311 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.34 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.52 
 
 		 312 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.66 
 
 		 313 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.25 
 
 		 313 aa  95.9  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.82 
 
 		 340 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.82 
 
 		 375 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.82 
 
 		 375 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  36.48 
 
 		 316 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  38.41 
 
 		 316 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  32.02 
 
 		 310 aa  92.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  40 
 
 		 318 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.88 
 
 		 289 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.46 
 
 		 308 aa  91.3  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.39 
 
 		 312 aa  91.3  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.11 
 
 		 310 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.11 
 
 		 310 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.45 
 
 		 371 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.93 
 
 		 371 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.33 
 
 		 340 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.57 
 
 		 314 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.75 
 
 		 315 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.99 
 
 		 305 aa  88.2  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.06 
 
 		 318 aa  88.6  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.33 
 
 		 331 aa  88.6  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.96 
 
 		 310 aa  88.2  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 		 352 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  32.12 
 
 		 310 aa  87.8  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  31.58 
 
 		 365 aa  87.8  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.07 
 
 		 311 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0862  esterase/lipase  37.24 
 
 		 432 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  34.55 
 
 		 312 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.21 
 
 		 375 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.48 
 
 		 310 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.44 
 
 		 320 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.84 
 
 		 317 aa  85.1  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  36.88 
 
 		 346 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.14 
 
 		 310 aa  85.1  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 		 320 aa  85.1  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.71 
 
 		 308 aa  84.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  32.28 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.55 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1841  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.05 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.34 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 		 628 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  33.15 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.68 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.53 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.54 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.16 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.71 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.19 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.42 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  35.33 
 
 		 353 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 		 317 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  32.28 
 
 		 328 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  38.46 
 
 		 344 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  30.11 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.82 
 
 		 349 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.9 
 
 		 308 aa  80.9  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.87 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.13 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.12 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.49 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.94 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.02 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.8 
 
 		 339 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  36.81 
 
 		 331 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.48 
 
 		 326 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.15 
 
 		 376 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>