63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0304 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  236  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  54.17 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  38.26 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.11 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.58 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  33.91 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  29.91 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  28.97 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  31.52 
 
 
249 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  31.52 
 
 
249 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  31.93 
 
 
128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  31.93 
 
 
128 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  34.67 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  31.93 
 
 
128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  28.83 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  25.42 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  21.74 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  27.03 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  33.78 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  37.7 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  37.7 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  33.87 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  31.65 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  26.02 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  22.61 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  33.33 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  22.52 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  24.14 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  24.59 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  25.69 
 
 
150 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  32.76 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  25.24 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  23.77 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  32.08 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  27.27 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  22.41 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.96 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  26.26 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.39 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  30.19 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.78 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  25.96 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  38.18 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  28.07 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  26.67 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  36.54 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>