27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3557 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40.68 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  36.16 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  35.59 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  35.03 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  32.77 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  29.83 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  32.2 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  31.25 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  26.88 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  26.58 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  27.54 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  25.62 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  25.61 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  25.43 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  24.69 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  24.38 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.22 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  20.71 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  23.84 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.56 
 
 		 604 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 604 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>