17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3284 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 736 aa  1514    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  49.79 
 
 		 760 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  48.54 
 
 		 722 aa  706    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  51.44 
 
 		 742 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  51.42 
 
 		 744 aa  738    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  40.97 
 
 		 759 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  41.83 
 
 		 741 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  39.2 
 
 		 748 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  25.05 
 
 		 672 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  25.05 
 
 		 672 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  25.05 
 
 		 672 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  24.9 
 
 		 622 aa  89.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  24.02 
 
 		 1005 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  26.36 
 
 		 818 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  22.24 
 
 		 628 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3344  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1064 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  27.21 
 
 		 968 aa  45.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>