More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2979 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  100 
 
 
211 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  58.29 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  44.44 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  44.93 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  40.55 
 
 
220 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  41.98 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  34.8 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.72 
 
 
201 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  33.16 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  32.84 
 
 
215 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.21 
 
 
213 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.2 
 
 
201 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 
199 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  34.31 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  32.84 
 
 
204 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  33.33 
 
 
201 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 
299 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  33.33 
 
 
201 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  33.33 
 
 
201 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  31.37 
 
 
204 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  31.03 
 
 
203 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.99 
 
 
205 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1961  glutathione S-transferase-like  36.73 
 
 
235 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  31.37 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  38.89 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 
205 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.07 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  28.92 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  28.92 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  29.76 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  29.38 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.76 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  31.03 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28.43 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  29.9 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
209 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 
210 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  29.9 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  29.9 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  29.9 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  29.9 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  28.29 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  28.91 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  32.58 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  28.07 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  28.92 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  25.98 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  30.24 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  27.54 
 
 
204 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.43 
 
 
202 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 
215 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  25.86 
 
 
214 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  33.13 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.1 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.83 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  28.43 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  27.45 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  26.47 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  28.49 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  31.06 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.06 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  31.61 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  24 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.49 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  27.01 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.1 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  28.57 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.49 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.49 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  26.96 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.62 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  27 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  27.88 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>