22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2653 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2653  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1369    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135557  normal  0.0988839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1965  hypothetical protein  27.19 
 
 		 711 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  33.53 
 
 		 8321 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.57 
 
 		 1597 aa  63.9  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 1963 aa  59.7  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  32.41 
 
 		 5094 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.43 
 
 		 1428 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.43 
 
 		 2555 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.13 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  29.13 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.36 
 
 		 1215 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.07 
 
 		 16311 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.54 
 
 		 6678 aa  48.5  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.29 
 
 		 2816 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.47 
 
 		 721 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.83 
 
 		 5020 aa  47.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.47 
 
 		 3191 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1538 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.5 
 
 		 7284 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.3 
 
 		 3816 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>