16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1916 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1916  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  32.81 
 
 		 254 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  28.72 
 
 		 516 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  20.81 
 
 		 307 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  21.91 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  25.52 
 
 		 519 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  24.71 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  26.58 
 
 		 521 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  23.29 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.7 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  25.17 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  27.2 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  38.6 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.38 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>