More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1006 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 547 aa  1136    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  51.58 
 
 		 548 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 		 545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 545 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 554 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  51.3 
 
 		 545 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 554 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 554 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  50.19 
 
 		 548 aa  568  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  51.57 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  51.12 
 
 		 545 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  50.93 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  50.74 
 
 		 545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  51.22 
 
 		 545 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 554 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  51.98 
 
 		 545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 545 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 554 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 554 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 		 554 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  50.48 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 554 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 554 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  47.49 
 
 		 547 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  49.07 
 
 		 553 aa  548  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 		 547 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 		 545 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 547 aa  535  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 549 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 552 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  48.08 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 552 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 		 548 aa  527  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  50.39 
 
 		 540 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 556 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  47.55 
 
 		 550 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  49.07 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  46.67 
 
 		 549 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  46.1 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  49.02 
 
 		 540 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  47.96 
 
 		 541 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  48.47 
 
 		 531 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  48.53 
 
 		 545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 548 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 		 551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 539 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  47.38 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 547 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  47 
 
 		 550 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  47.48 
 
 		 549 aa  515  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 559 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  47.38 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 549 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  47.29 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 550 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 550 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>