28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4486 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  98.67 
 
 
150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  90.06 
 
 
161 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  89.44 
 
 
161 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  61.64 
 
 
161 aa  217  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  63.09 
 
 
151 aa  208  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  60.38 
 
 
161 aa  207  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  59.12 
 
 
161 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  59.12 
 
 
161 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  48.65 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  50.77 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  41.36 
 
 
165 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  51.3 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  53.78 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  47.76 
 
 
150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  29.37 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  24.56 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  24 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  32.79 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  23.33 
 
 
150 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  29.46 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  23.88 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  25.2 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  24.78 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>