87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1730 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1725  patatin  91.34 
 
 
380 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  89.03 
 
 
383 aa  695    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  100 
 
 
372 aa  772    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  97.58 
 
 
372 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  96.51 
 
 
372 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  74.85 
 
 
335 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  74.85 
 
 
335 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  71.26 
 
 
344 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  68.28 
 
 
415 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  60.42 
 
 
378 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  52.68 
 
 
345 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  48.54 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  38.72 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  38.72 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  37.82 
 
 
638 aa  212  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  38.41 
 
 
422 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  37.7 
 
 
373 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  36.1 
 
 
357 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  36.1 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  36.1 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  36.1 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  36.1 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  35.78 
 
 
357 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  35.78 
 
 
357 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  35.78 
 
 
357 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  35.46 
 
 
357 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  36.42 
 
 
357 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  36.1 
 
 
364 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  36.1 
 
 
364 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  36.1 
 
 
357 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  36.1 
 
 
364 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  35.46 
 
 
356 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  31.41 
 
 
282 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  31.27 
 
 
305 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  29.76 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.6 
 
 
383 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.88 
 
 
290 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  28.66 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  35.68 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  30.18 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  26.52 
 
 
287 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  25.08 
 
 
279 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  26.75 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  25.08 
 
 
279 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  24.91 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  23.96 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  23.64 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  23.64 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  23.64 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  23.64 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  23.64 
 
 
284 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  23.64 
 
 
284 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  23.96 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  23.64 
 
 
284 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  23.64 
 
 
284 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  27.95 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  28.95 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  27.51 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  27.95 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.89 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  23.97 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.95 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  23.88 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  26.18 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  23.89 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.39 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  23.89 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  24.2 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  24.2 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  23.51 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  24.68 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  26.09 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  27.83 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.3 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  29.93 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  24.68 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  23.03 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.07 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  23.23 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  24.26 
 
 
283 aa  60.1  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  21.79 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  25.31 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  23.79 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.67 
 
 
320 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.39 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  21.93 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>