More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3624 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3624  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 
234 aa  486  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.71107  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3682  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  93.62 
 
 
235 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3806  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  93.19 
 
 
235 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00214907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0612  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  93.19 
 
 
235 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0851236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3216  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  80.77 
 
 
219 aa  359  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000219116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3336  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  75.73 
 
 
224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3506  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  71.3 
 
 
225 aa  324  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156362  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0774  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  73.79 
 
 
224 aa  320  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0617  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  69.06 
 
 
228 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000501463  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3311  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  60.4 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3069  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  58.51 
 
 
203 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3159  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  58.64 
 
 
231 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3984  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  57.37 
 
 
207 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.815379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0828  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  49.15 
 
 
253 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000562613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3686  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  57.81 
 
 
241 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3648  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  52.38 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3472  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  53.76 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0685  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  54.4 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000121077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2055  hypothetical protein  55.21 
 
 
194 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000941629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002481  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  50.79 
 
 
199 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2541  putative 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  52.94 
 
 
193 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03554  hypothetical protein  51.83 
 
 
197 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3331  putative ligase  52.63 
 
 
198 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000278914  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0857  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  51.05 
 
 
198 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0860  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.05 
 
 
198 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00252487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3824  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  51.05 
 
 
198 aa  204  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0781  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.58 
 
 
200 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0798  putative ligase  51.58 
 
 
200 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000314962  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4205  putative ligase  51.58 
 
 
200 aa  204  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000113142  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0447  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.05 
 
 
213 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3922  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  55.11 
 
 
226 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203046  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3045  putative ligase  51.58 
 
 
200 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3332  putative ligase  51.05 
 
 
248 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000964755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02743  predicted ligase  52.2 
 
 
182 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3070  putative ligase  52.2 
 
 
182 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000340547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02706  hypothetical protein  52.2 
 
 
182 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000385282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3239  putative ligase  51.65 
 
 
182 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0602  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.08 
 
 
196 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3591  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  54.65 
 
 
204 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3295  putative ligase  51.05 
 
 
198 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000506404  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3298  putative ligase  51.05 
 
 
204 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000163659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0544  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  49.73 
 
 
213 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3221  putative ligase  52 
 
 
198 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2726  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  49.75 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3507  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  48.44 
 
 
198 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.805722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3233  putative ligase  51.87 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0213409  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3400  putative ligase  50 
 
 
198 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00411239  normal  0.605032 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0648  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  42.47 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03206  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42 
 
 
229 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1562  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.42 
 
 
192 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0021  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  44.44 
 
 
208 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.320166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2769  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.16 
 
 
200 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00685843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1129  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  46.86 
 
 
194 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2040  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.99 
 
 
197 aa  118  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0129  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  33.85 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000088129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0643  hypothetical protein  38.8 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0627  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2773  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  36.84 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.57 
 
 
211 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2724  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  36.27 
 
 
199 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.369069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0317  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.13 
 
 
203 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0115  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.7 
 
 
226 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1181  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.1 
 
 
203 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3517  hypothetical protein  35.08 
 
 
194 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000273228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5971  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  38.54 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0698  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.16 
 
 
194 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0899  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, putative  34.02 
 
 
194 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69040  putative 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  37.5 
 
 
203 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0694  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.63 
 
 
196 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36 
 
 
204 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.27126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5029  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40 
 
 
202 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958925  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02382  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  35.29 
 
 
202 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3281  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.02 
 
 
197 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0922138  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.72 
 
 
198 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5227  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  38.04 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5111  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.51 
 
 
202 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.170961  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  34.29 
 
 
191 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5203  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.89 
 
 
202 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1799  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.75 
 
 
175 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0782  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.22 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0334032  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5264  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.89 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0844  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.52 
 
 
196 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5438  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.57 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1658  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.04 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00123721  normal  0.619809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2319  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  27.98 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0962  putative 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.42 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0436  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.69 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.86 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.818693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2164  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.91 
 
 
182 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1194  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.65 
 
 
199 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0246717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2633  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  27.46 
 
 
192 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47370  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like protein  37.72 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1136  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  31.55 
 
 
187 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2618  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.8 
 
 
196 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2351  putative ligase  34.21 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000100293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0714  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.7 
 
 
196 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.251502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.34 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3649  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  30.37 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1062  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.27 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.849255  normal  0.0474843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1723  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  29.95 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>