39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4681 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  100 
 
 		 60 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  63.33 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1810  YcfA family protein  48.21 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4826  YcfA family protein  52.73 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0452  hypothetical protein  50.94 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0486055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0742  YcfA family protein  46.55 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.837375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4129  YcfA-like  56.76 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0904081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4143  YcfA-like  51.92 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.166657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  43.33 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  46.67 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0973  YcfA-like  43.4 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254811  hitchhiker  0.00147891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  45 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2635  YcfA family protein  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  43.33 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  42.37 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  40.35 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  46.03 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1413  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000113002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  41.67 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  41.67 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  40 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  41.67 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  40 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  39.66 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1007  YcfA family protein  33.87 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.29873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  41.67 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1937  hypothetical protein  47.5 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000016958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  37.29 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  33.9 
 
 		 74 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  33.9 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  41.38 
 
 		 63 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  35.48 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  35 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  36.67 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  36.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>