21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4539 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  98.4 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  98.4 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  98.4 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  93.62 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  50 
 
 		 186 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  29.94 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  34.35 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  29.86 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  27.44 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  27.39 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  25.71 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  25.79 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  24.24 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  26.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  26.61 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  22.16 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  22.16 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  21.01 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4011  TraE family protein  22 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>