24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1014 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  100 
 
 		 352 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  96.72 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  43.68 
 
 		 1258 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  42.53 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  43.02 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  43.02 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  42.53 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  42.53 
 
 		 407 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  42.53 
 
 		 437 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  41.38 
 
 		 1007 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  41.38 
 
 		 1137 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  43.02 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  41.38 
 
 		 1120 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  41.86 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  42.53 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  42.53 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  42.53 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  40.23 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  40 
 
 		 845 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  42.53 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  42.53 
 
 		 791 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  42.53 
 
 		 805 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  41.38 
 
 		 892 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  37.23 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>