30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2692 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  100 
 
 		 404 aa  823    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  26.87 
 
 		 368 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  27.07 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  25.85 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1392  putative phage related integrase  24.49 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107994  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4008  phage-related integrase  28.51 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  30.43 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3026  hypothetical protein  30.36 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.83 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1581  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0915867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1638  phage-related integrase  39.34 
 
 		 129 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  31 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.21 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  43.64 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  43.64 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.7 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8257  integrase/recombinase  29.52 
 
 		 109 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0245886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  24.9 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.95 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.31 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  34.09 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  23.96 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 306 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 306 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  22.73 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>