33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2550 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2550  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  313  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1114  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 266 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2099  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2685  hypothetical protein  43.82 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0857  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2222  regulatory protein, MarR  45.95 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1851  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184496  normal  0.37635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1241  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2488  DNA repair protein RadC  41.54 
 
 		 354 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386498  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2901  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  45.65 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  43.64 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  28.43 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.09 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>