21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2157 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4011  TraE family protein  54.34 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5366  TraE family protein  48.63 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  25 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  27.59 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  23.64 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  26.62 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  30.23 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  25.19 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  22.16 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.75 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1079  type IV conjugative transfer system protein TraE  26.06 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360981  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3781  putative sex pilus assembly and synthesis protein  18.44 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.271719  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  24 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  24.43 
 
 		 186 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0930  putative conjugative transfer protein TraE  22.7 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0844234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>