40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0242 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  57.45 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  51.82 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  45.71 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  41.13 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  45 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  45 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  41.06 
 
 
170 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  41.5 
 
 
180 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  44.7 
 
 
161 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  42.42 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  42.42 
 
 
161 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  40.74 
 
 
158 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  39.13 
 
 
150 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  40.44 
 
 
165 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  44.7 
 
 
167 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  44.7 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  41.43 
 
 
152 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  41.84 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  43.08 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  43.94 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  45.89 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  42.03 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  41.1 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  36.96 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  43.26 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  36.65 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  42.75 
 
 
146 aa  94  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  39.42 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  38.69 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  40.41 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  40.15 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  43.08 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  40.43 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  38.35 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  33.06 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1185  hypothetical protein  31.34 
 
 
240 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3203  hypothetical protein  31.25 
 
 
310 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>