41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2325 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  46.34 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  44.55 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  44.55 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  45.28 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  44.08 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  48.31 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  45.85 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  48.31 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  47.19 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  44.86 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  43.18 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  44.32 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  44.19 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  42.11 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  44.57 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  29.94 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  29.3 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  26.49 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  28.33 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  26.81 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  24.71 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  29.45 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  27.07 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  23.03 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  31.86 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  24.79 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  26.24 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  28.93 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  25.64 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  24.55 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  25.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  26.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  26.62 
 
 		 313 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  27.72 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  28.83 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>