13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0717 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1192    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  32.34 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  32.06 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0737  hypothetical protein  31.33 
 
 		 625 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0144  hypothetical protein  31.89 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  31.4 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  26.52 
 
 		 605 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  40.48 
 
 		 380 aa  52.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  31.65 
 
 		 956 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  44.62 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  34.52 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  39.36 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  43.1 
 
 		 757 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>