28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1569 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1569  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  930    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.62 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.03 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  32.5 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13038  hypothetical protein  24.17 
 
 		 459 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.17 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.63 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.71 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  26.26 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6267  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2099  hypothetical protein  20.65 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  30.17 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.09 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  28.34 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  29.5 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>