26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3787 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  27.05 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  28.08 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1335  hypothetical protein  33.94 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0993069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  26.12 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  31.78 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  26.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  26.85 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  30.14 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  20.1 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  30.14 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  30.14 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  31.53 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  29.7 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  29.25 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  30.28 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  29.25 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  25.95 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  26.92 
 
 		 269 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>