More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1145 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  100 
 
 		 457 aa  918    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  82.96 
 
 		 457 aa  725    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  82.96 
 
 		 457 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  82.46 
 
 		 457 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  82.96 
 
 		 457 aa  725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  91.87 
 
 		 457 aa  844    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  82.74 
 
 		 457 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  53.75 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  50.68 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  54.79 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  41.18 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  40.75 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  42.53 
 
 		 447 aa  322  8e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  43.39 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  41.69 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  39.1 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  39.73 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  35.84 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  38.33 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  36.53 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  38.51 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  35.56 
 
 		 463 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  37.3 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  36.14 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.56 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  35.43 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.22 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  36.26 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.56 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  33.78 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.63 
 
 		 460 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.22 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33.49 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  30.43 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  33.11 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  33.89 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  31.45 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  33.65 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.07 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  36.24 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.28 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.12 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  30.16 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  31.77 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  30.69 
 
 		 466 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  35.78 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  35.78 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  34.7 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.35 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.35 
 
 		 442 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.7 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  33.88 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.95 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  32.69 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  30.33 
 
 		 468 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  30.16 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  28.92 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  30.67 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  32.06 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  33.16 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  33.16 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  28.82 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.41 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  31.01 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  29.74 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  30.14 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31.89 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  33.42 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31.38 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31.89 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  31.4 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  30.63 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.18 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  29.91 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.45 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  32.73 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  33.65 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29.64 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  30.73 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  31.62 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  28.23 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  28.6 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  33.86 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  33.6 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  30.48 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  31.49 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  30.34 
 
 		 486 aa  199  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  28.42 
 
 		 461 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  28.42 
 
 		 461 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  29.52 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  34.78 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  30.71 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  30.34 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  30.31 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  27.17 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  29.28 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  30.39 
 
 		 449 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  29.45 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>