29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0288 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  950    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  68.08 
 
 		 471 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  68.35 
 
 		 471 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  67.24 
 
 		 464 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  63.69 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  60.33 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  59.84 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  59.27 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  59.15 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  41.44 
 
 		 467 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  39.84 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  41.04 
 
 		 511 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  40.17 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  39.28 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  37.57 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  37.86 
 
 		 511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  28.64 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  26.11 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  23.19 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.48 
 
 		 563 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  29.91 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  29.6 
 
 		 305 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  29.6 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  29.6 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  30.58 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  34.82 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  27.8 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  24.31 
 
 		 525 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  30.68 
 
 		 469 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>