85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3522 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  56.29 
 
 		 657 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  51.37 
 
 		 680 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  71.01 
 
 		 704 aa  976    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  56.29 
 
 		 689 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  80.18 
 
 		 678 aa  1096    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  80.18 
 
 		 678 aa  1092    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  79.74 
 
 		 678 aa  1088    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  57.27 
 
 		 674 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  80.18 
 
 		 678 aa  1093    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  55.7 
 
 		 689 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  80.18 
 
 		 678 aa  1093    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  80.18 
 
 		 678 aa  1093    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  80.18 
 
 		 678 aa  1095    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  99.41 
 
 		 680 aa  1370    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  79.88 
 
 		 678 aa  1091    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  98.82 
 
 		 680 aa  1365    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  99.26 
 
 		 680 aa  1370    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  99.26 
 
 		 680 aa  1370    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  100 
 
 		 680 aa  1379    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  54.36 
 
 		 672 aa  701    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  54.07 
 
 		 672 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  51.37 
 
 		 682 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  80.18 
 
 		 678 aa  1096    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  31.99 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  25.59 
 
 		 677 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  26.77 
 
 		 626 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  35.09 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  26.58 
 
 		 634 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  33.23 
 
 		 603 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  32.92 
 
 		 603 aa  165  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  32.4 
 
 		 653 aa  161  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  31.82 
 
 		 607 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  25.69 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.99 
 
 		 616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  29.61 
 
 		 634 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 604 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  31.38 
 
 		 602 aa  143  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  29.33 
 
 		 634 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  29.33 
 
 		 634 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  29.05 
 
 		 634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  30.18 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 595 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  28.71 
 
 		 624 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  30 
 
 		 604 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  29.74 
 
 		 619 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  29.46 
 
 		 627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  29.66 
 
 		 628 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  28.9 
 
 		 627 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  23.68 
 
 		 661 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  27.26 
 
 		 625 aa  127  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  28.84 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  24.6 
 
 		 658 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  31.23 
 
 		 607 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  29.27 
 
 		 605 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  22.35 
 
 		 721 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  27.99 
 
 		 617 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  29.25 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  26.52 
 
 		 629 aa  108  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  28.01 
 
 		 605 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  27.6 
 
 		 635 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  27.41 
 
 		 605 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  27.41 
 
 		 605 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.55 
 
 		 603 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  25.47 
 
 		 396 aa  97.8  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 394 aa  97.8  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  24.04 
 
 		 631 aa  94  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  20.78 
 
 		 666 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  22.42 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  27.33 
 
 		 705 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  25.68 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  26.88 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  29.21 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  22.7 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  21.33 
 
 		 617 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  22.44 
 
 		 621 aa  60.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  23.93 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  23.93 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  22.05 
 
 		 573 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  25.35 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  25.35 
 
 		 576 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  23.31 
 
 		 407 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 400 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 399 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>