17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1092 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  100 
 
 		 322 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  99.07 
 
 		 322 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  90.14 
 
 		 788 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  88.73 
 
 		 788 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  88.73 
 
 		 788 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  73.45 
 
 		 776 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  42.99 
 
 		 755 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  42.06 
 
 		 765 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  42.06 
 
 		 755 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  42.06 
 
 		 755 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  44.79 
 
 		 731 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  37.07 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  36.21 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3517  hypothetical protein  24.66 
 
 		 889 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  36.21 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  36.21 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  35.34 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
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