88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1896 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  49.2 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  49.2 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2040  abortive infection family protein  38.1 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21550  CAAX amino terminal protease family  33.33 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1892  caax amino protease family protein  28.83 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0053  CAAX amino terminal protease family protein  28.83 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000276031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3454  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0370625  hitchhiker  5.35761e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  29.14 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  43.48 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2039  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3139  CAAX amino terminal protease family protein  26.54 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0470629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3486  CAAX amino terminal protease family protein  26.54 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3233  CAAX amino terminal protease family protein  26.54 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3447  CAAX amino terminal protease family protein  26.54 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3281  abortive infection protein  37.63 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  29.73 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  31.53 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.03 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  31.53 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  31.67 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  36.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  41.98 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  30.1 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.97 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  39.51 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  37.11 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  25.48 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  22.96 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  31.97 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  32.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  39 
 
 		 602 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  27.94 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  34.01 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  26.06 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  33.88 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  33.93 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  33.66 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  39.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  33.71 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  34.78 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2537  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2488  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.518759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3461  caax amino protease family protein  34.17 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  33.63 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3207  CAAX amino terminal protease family protein  34.17 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000028655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  31.79 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  35.96 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.3 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  30.84 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  32.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  32.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  32.99 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  32.99 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  31.51 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30.85 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0040  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  31.51 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2113  abortive infection family protein  29.77 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00391634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  23.79 
 
 		 432 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  36.26 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  31.82 
 
 		 420 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  27.5 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  31.68 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  25.96 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  29.07 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  33.9 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.43 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.35 
 
 		 313 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  30.43 
 
 		 453 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>