26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3097 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  725    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  44.52 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  41.83 
 
 
362 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  39.88 
 
 
326 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  33.2 
 
 
423 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  24.92 
 
 
746 aa  86.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  31.85 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  28.85 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  30.62 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  27.2 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  30.99 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  30.66 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  29.54 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  27.31 
 
 
678 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
673 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  25.78 
 
 
591 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  34.31 
 
 
769 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  23.5 
 
 
1182 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  25.5 
 
 
430 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  29.93 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  26.29 
 
 
425 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
1185 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  25.64 
 
 
471 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  25.79 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  22.69 
 
 
478 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>