More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2849 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  100 
 
 
330 aa  630  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  47.04 
 
 
332 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  47.04 
 
 
332 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  41.42 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  40.58 
 
 
338 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  38.34 
 
 
349 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  40 
 
 
327 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  39.62 
 
 
334 aa  215  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  42.07 
 
 
355 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  42.12 
 
 
355 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  41.48 
 
 
355 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  40.78 
 
 
354 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  40.51 
 
 
328 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  34.29 
 
 
322 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  35.35 
 
 
327 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  35.03 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  42.73 
 
 
329 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  39.68 
 
 
320 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  38.41 
 
 
320 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  35.05 
 
 
324 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  31.63 
 
 
327 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  35.28 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  35.28 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  33.93 
 
 
348 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  34.91 
 
 
338 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  33.33 
 
 
320 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  33.65 
 
 
322 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  33.65 
 
 
322 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3641  asparaginase/glutaminase  40.13 
 
 
300 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  34.38 
 
 
324 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  33.75 
 
 
322 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.54 
 
 
324 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  33.44 
 
 
347 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  41.07 
 
 
327 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1153  asparaginase/glutaminase  41 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  35.85 
 
 
348 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0058  Asparaginase/glutaminase  45.88 
 
 
320 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149334  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  33.85 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  35.89 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2327  Asparaginase/glutaminase  47.19 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  35.6 
 
 
324 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  35.6 
 
 
324 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  35.6 
 
 
324 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  41.07 
 
 
327 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  40.58 
 
 
352 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  35.89 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  33.65 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  35.89 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  37.13 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39060  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  42.04 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  37.17 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  38.18 
 
 
340 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2999  Asparaginase/glutaminase  41.94 
 
 
328 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  37.42 
 
 
396 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3114  asparaginase  41.91 
 
 
309 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  39.12 
 
 
340 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3399  asparaginase/glutaminase  38.98 
 
 
312 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  37.42 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  34.27 
 
 
348 aa  160  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  35.6 
 
 
323 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  37.38 
 
 
321 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  38.92 
 
 
340 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  39.35 
 
 
346 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  34.27 
 
 
348 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  32.82 
 
 
356 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  38.36 
 
 
340 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  32.82 
 
 
352 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  35.89 
 
 
310 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  38.36 
 
 
365 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  39.05 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  38.36 
 
 
365 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  32.82 
 
 
352 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  32.82 
 
 
352 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3094  asparaginase/glutaminase  41.58 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  33.64 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3154  asparaginase/glutaminase  41.58 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  37.11 
 
 
347 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  33.13 
 
 
354 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  41.37 
 
 
327 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  38.06 
 
 
338 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.88 
 
 
328 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  33.23 
 
 
338 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  36.84 
 
 
367 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  31.95 
 
 
347 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  39.05 
 
 
350 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  37.58 
 
 
350 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  32.7 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  36.23 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2772  asparaginase/glutaminase  42.29 
 
 
299 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0462743  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  39.14 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  38.97 
 
 
323 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  32.19 
 
 
352 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  32.81 
 
 
349 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  34.92 
 
 
316 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  33.33 
 
 
316 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>