74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2292 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2292  methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  30.16 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  26.47 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  26.21 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
204 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
204 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
225 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  34.25 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
262 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.61 
 
 
420 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
409 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  35.96 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  23.91 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
233 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 
234 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.36 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  30.14 
 
 
653 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  28.68 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.26 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
853 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.09 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.42 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  25.37 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.78 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
220 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.72 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1935  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 
363 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
237 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
342 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.66 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.19 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  30 
 
 
243 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
206 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.55 
 
 
237 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  23.86 
 
 
205 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
266 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  27.63 
 
 
224 aa  42  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>