More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0206 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  943    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  58.48 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  45.95 
 
 
445 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  44.21 
 
 
490 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  43.18 
 
 
419 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  47.11 
 
 
428 aa  319  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  41.23 
 
 
466 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  38.82 
 
 
451 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  38.72 
 
 
459 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  38.96 
 
 
456 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  35.21 
 
 
451 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  38.27 
 
 
501 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  38.23 
 
 
414 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  38.34 
 
 
482 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  36.87 
 
 
461 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  35.16 
 
 
487 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  36.03 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  35.57 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  34.73 
 
 
504 aa  221  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  33.56 
 
 
520 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  30.57 
 
 
466 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.01 
 
 
441 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  28.87 
 
 
437 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.05 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  27.72 
 
 
434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  30.5 
 
 
445 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.44 
 
 
434 aa  159  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.85 
 
 
447 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  28.04 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.67 
 
 
439 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.87 
 
 
422 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 
440 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.6 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.67 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  25.11 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.05 
 
 
434 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.06 
 
 
431 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.74 
 
 
436 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.84 
 
 
428 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  25.64 
 
 
422 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.84 
 
 
432 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.89 
 
 
431 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.76 
 
 
422 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.41 
 
 
422 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.78 
 
 
447 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.48 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.37 
 
 
431 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.72 
 
 
441 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  26.34 
 
 
466 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  27.75 
 
 
473 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.51 
 
 
433 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.41 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  28.29 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.64 
 
 
459 aa  130  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  27.59 
 
 
491 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.56 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.56 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  28.6 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  28.57 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  27.17 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  27.87 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.55 
 
 
448 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.16 
 
 
444 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  28.34 
 
 
434 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.48 
 
 
663 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  23.29 
 
 
428 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.12 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.85 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  26.52 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  28.01 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  27.4 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.78 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.08 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 
465 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  28.57 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.31 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.36 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.52 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.59 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  25.93 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.62 
 
 
470 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.41 
 
 
454 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  26.86 
 
 
476 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  25.39 
 
 
469 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.27 
 
 
656 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.62 
 
 
470 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.62 
 
 
470 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.99 
 
 
439 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23.13 
 
 
431 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  26.38 
 
 
458 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.23 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.61 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  26.68 
 
 
663 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  23.61 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.23 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.89 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.63 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  24.84 
 
 
440 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  27.11 
 
 
470 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>