59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3827 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  330  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  98.82 
 
 		 170 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  83.53 
 
 		 178 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  38.06 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  35.06 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  36.03 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  31.48 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  37.86 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  35.14 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.23 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  31.53 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  32.11 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  34.68 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  32.11 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  27.61 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  29.71 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  30.94 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  28.32 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  31.37 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  30.09 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  33.64 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  32.38 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  33.64 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  28.83 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  28.83 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  30.91 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  30.48 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  28.85 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  28.83 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  23.53 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  28.32 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  29.27 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  29.52 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  27.03 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  29.9 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  25.33 
 
 		 146 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  22.96 
 
 		 139 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  30.15 
 
 		 140 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  35.48 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  25.44 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>