18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0630 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  100 
 
 		 1253 aa  2537    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1221 aa  602  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1221 aa  602  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  32.7 
 
 		 849 aa  352  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  32.45 
 
 		 1564 aa  301  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1267  hypothetical protein  47.73 
 
 		 694 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1153 aa  268  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  22.73 
 
 		 885 aa  84.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  22.6 
 
 		 885 aa  81.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  27.65 
 
 		 1915 aa  76.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  23.93 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  24.37 
 
 		 1093 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  30.22 
 
 		 934 aa  55.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  26.42 
 
 		 702 aa  53.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  23.66 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  22.78 
 
 		 2400 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1830 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  28.12 
 
 		 694 aa  48.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>