33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0184 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0184  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1534  putative acyl carrier protein  98.77 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2339  putative acyl carrier protein  48.65 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0414  putative acyl carrier protein  41.03 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230506  normal  0.0244859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1634  putative acyl carrier protein  40.54 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0265419  normal  0.0223773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0883  putative acyl carrier protein  36 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3943  putative acyl carrier protein  34.85 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  31.58 
 
 		 473 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6430  putative acyl carrier protein (ACP)  33.33 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  32.1 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  38.82 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  36 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  34.55 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1302  acyl carrier protein, putative  30.26 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  32.1 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  35 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  38.55 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2227  phosphopantetheine-binding  36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1489  acyl carrier protein, putative  28 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3195  hypothetical protein  32.1 
 
 		 80 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>